اعتقل الإخوان في يناير 1954 م ثم أفرج عنهم في مارس 1954 م ثم أعيد اعتقالهم بعنف وقسوة بعد شهور قليلة ...
وشاءت أقدار الله أن يكون الأستاذ الهضيبي خارج مصر في زيارة للسعودية، وسوريا، لبنان.
فما أن سمع بالمحنة حتى أمر بالتجهيز للعودة إلى مصر، وسارع بالرحلة إلى مصر ليكون مع إخوانه وجنوده في محنتهم يثبت بعضهم بعضاً بعون الله، ووفاءً بتبعة القيادة.